当社は孝謙天皇（奈良時代）の御代、天平勝宝３年（751）九州の宇佐八幡宮を勧請して（当時の下二万外和崎）八幡宮と称し、上二万村の氏神様として祀った。
　その後、後奈良天皇の弘治元年（1555）４月に現在の地に遷座された。
　元和５年（1619）岡田藩主の伊東氏の領有となってから、この宮を祈願所として尊び、藩から毎年幣帛料が寄進されていた。
　明治２年八幡宮の名称を上二萬神社と改称して現在に至る。ここは地勢高壮にして見晴らし良く、伊東氏はこの地に着任し服部に居住していたが、その後この二万村に暫く居住した頃、当社は既にこの地に移転しており、その為特別の崇敬を受けた。