当社は備前国津高郡上田村案田化気山鎮座。第１０代崇神天皇の１０年孝霊天皇の皇子大吉備津彦命四道将軍の一員として吉備国に派遣　異母弟若日子武命と共に針間（播磨）国から本宮山の峯に来られた。この所に御食津神を祀られた。これは、越前国敦賀気比神社と同じく伊奢沙和氣神を祀る。この気比神社の社名を上下間違え、比を化と読み誤り社名が化気神社となったと言い伝えられる。その後４４代元正天皇養老８年に皇子、西国の賊徒平定の為西下の途上、備前牛窓に御仮泊にわかに御脳有り諸郷丹心をこめて御脳平癒賊徒平定を祈請せられた時、長田庄本宮山の峯より霊光牛窓海上に映じご加護有り、奉賽の為、本宮山に行幸された。その途中、道に迷った時に白鹿が現れ教導した。是は、伊奢沙和氣神の霊験であると言われた。依って神宝に『いさざ王』と言う丈１尺８寸４分の鹿角を祀られた。
　その後、大和漆上郡春日大明神４柱、武甕槌神、齋主神、天兒屋根神、比賣神を祀り、伊奢沙和氣神と合わせ５柱の祭神を祀る。