当社は古くには五社権現三社宮と称し、文久年間（1861～1863）に摂津国の溝唯城主長谷川家の分家長谷川長三郎がこの地を治めていた当時、領主の祈願所として創建された。
　明治４年三社宮と改称し、同６年に村社に列格した。昭和１９年１０月１５日三社神社と改称した。
　昭和２０年１０月１５日神饌幣帛料供進神社に指定される。
　飛び地境内神社の素盞嗚神社例祭を祇園祭とも称し、倉敷３名祭の１つとして数えられている。