当社の創建年代は不詳であるが、小原に創建したと伝えられている。その後修理、再建が行われ、祭日には氏子全戸が参拝する習慣が今日まで行われている。
　明治１１年に矢崎神社と改称した。昭和５１年には、社殿、参道等を整備した。